Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lire1P11260 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lire1P11260 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lire1P11260 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms