Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl2P10889 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl2P10889 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms