Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P10404 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P10404 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P10404 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P10404 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P10404 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P10404 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P10404 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P10404 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P10404 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P10404 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P10404 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P10404 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P10404 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P10404 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P10404 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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