Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd8bP10300 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd8bP10300 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd8bP10300 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms