Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Myod1P10085 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Myod1P10085 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms