Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Schip1P0DPB4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Schip1P0DPB4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms