Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CatspereP0DP43 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CatspereP0DP43 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms