Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1bP0C7A0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1bP0C7A0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms