Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NefmP08553 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NefmP08553 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NefmP08553 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NefmP08553 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefmP08553 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefmP08553 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefmP08553 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefmP08553 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefmP08553 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NefmP08553 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NefmP08553 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NefmP08553 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NefmP08553 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NefmP08553 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NefmP08553 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NefmP08553 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NefmP08553 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NefmP08553 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NefmP08553 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NefmP08553 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NefmP08553 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NefmP08553 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NefmP08553 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NefmP08553 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NefmP08553 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NefmP08553 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NefmP08553 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NefmP08553 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NefmP08553 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NefmP08553 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms