Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NeflP08551 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NeflP08551 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NeflP08551 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeflP08551 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NeflP08551 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NeflP08551 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NeflP08551 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NeflP08551 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NeflP08551 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NeflP08551 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NeflP08551 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NeflP08551 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NeflP08551 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NeflP08551 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NeflP08551 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NeflP08551 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NeflP08551 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NeflP08551 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NeflP08551 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NeflP08551 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NeflP08551 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NeflP08551 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NeflP08551 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NeflP08551 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NeflP08551 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NeflP08551 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NeflP08551 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NeflP08551 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NeflP08551 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NeflP08551 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NeflP08551 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NeflP08551 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NeflP08551 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NeflP08551 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NeflP08551 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NeflP08551 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NeflP08551 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NeflP08551 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms