Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApoeP08226 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApoeP08226 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApoeP08226 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ApoeP08226 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms