Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GzmbP04187 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GzmbP04187 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms