Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01809 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01809 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01809 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01809 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01809 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01809 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01809 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01809 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01809 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01809 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01809 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01809 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01809 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01809 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01809 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01809 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01809 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01809 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01809 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms