Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01806 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01806 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01806 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01806 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01806 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01806 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01806 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01806 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01806 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01806 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01806 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01806 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01806 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms