Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01728 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01728 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01728 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01728 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01728 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01728 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms