Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtco2P00405 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms