Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pde4aO89084 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pde4aO89084 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms