Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcn2O88968 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms