Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JtbO88824 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JtbO88824 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JtbO88824 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JtbO88824 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JtbO88824 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JtbO88824 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JtbO88824 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JtbO88824 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JtbO88824 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JtbO88824 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JtbO88824 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
JtbO88824 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms