Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema3fO88632 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema3fO88632 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms