Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cops6O88545 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops6O88545 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops6O88545 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops6O88545 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops6O88545 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops6O88545 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops6O88545 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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