Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnmt3bO88509 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnmt3bO88509 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnmt3bO88509 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnmt3bO88509 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms