Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nme6O88425 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme6O88425 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms