Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnnt1O88346 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnnt1O88346 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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