Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfdp1O88271 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfdp1O88271 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfdp1O88271 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms