Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Srpk1O70551 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srpk1O70551 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srpk1O70551 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms