Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Foxq1O70220 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Foxq1O70220 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms