Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp8O70138 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp8O70138 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms