Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rad51dO55230 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51dO55230 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms