Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkbO55229 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkbO55229 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkbO55229 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms