Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtogO55225 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtogO55225 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtogO55225 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtogO55225 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtogO55225 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtogO55225 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtogO55225 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
OtogO55225 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtogO55225 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtogO55225 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms