Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Supt5hO55201 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt5hO55201 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms