Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp26a1O55127 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp26a1O55127 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms