Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp10O55123 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp10O55123 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp10O55123 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms