Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Copb2O55029 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Copb2O55029 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms