Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema6bO54951 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sema6bO54951 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6bO54951 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms