Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd200O54901 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms