Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsksO54887 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsksO54887 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsksO54887 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsksO54887 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TsksO54887 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TsksO54887 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TsksO54887 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TsksO54887 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TsksO54887 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TsksO54887 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TsksO54887 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsksO54887 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsksO54887 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsksO54887 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsksO54887 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms