Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffbO54788 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffbO54788 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffbO54788 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffbO54788 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffbO54788 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffbO54788 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffbO54788 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffbO54788 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DffbO54788 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DffbO54788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DffbO54788 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffbO54788 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffbO54788 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffbO54788 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DffbO54788 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms