Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf9O35739 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf9O35739 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf9O35739 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms