Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NudcO35685 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NudcO35685 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NudcO35685 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NudcO35685 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NudcO35685 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NudcO35685 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NudcO35685 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NudcO35685 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NudcO35685 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NudcO35685 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NudcO35685 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NudcO35685 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NudcO35685 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NudcO35685 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NudcO35685 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NudcO35685 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NudcO35685 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NudcO35685 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NudcO35685 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NudcO35685 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NudcO35685 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NudcO35685 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NudcO35685 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms