Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk2O35491 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk2O35491 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clk2O35491 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clk2O35491 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms