Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kpna3O35344 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kpna3O35344 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms