Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Nedd9O35177 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd9O35177 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Nedd9O35177 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Nedd9O35177 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Nedd9O35177 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd9O35177 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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