Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx3O35160 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx3O35160 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms