Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ArxO35085 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ArxO35085 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ArxO35085 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ArxO35085 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ArxO35085 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ArxO35085 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ArxO35085 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArxO35085 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArxO35085 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArxO35085 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArxO35085 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArxO35085 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ArxO35085 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ArxO35085 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ArxO35085 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ArxO35085 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ArxO35085 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms