Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn4O35054 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn4O35054 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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