Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap23O09044 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap23O09044 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap23O09044 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap23O09044 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap23O09044 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap23O09044 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms