Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltbp2O08999 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ltbp2O08999 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ltbp2O08999 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms