Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn1O08788 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dctn1O08788 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms